構造ベースの薬剤探索において KOYA と ZAO が担う役割

構造ベースの薬剤探索は、まず「形」から始まります。ターゲットとなる結合ポケットや活性部位、相互作用界面といった立体構造が、分子に求められる形を規定します。そこから妥当なリード化合物に到達するまでの各サイクルで、研究チームは同じ二つの問いを繰り返します。「次に何を設計すべきか」、そして「今設計したものはどれくらい良いのか」。

この二つの問いは実務上、異なるツール・異なるファイル形式、時には異なるチームに分かれて存在しがちで、そこがイテレーションのスピードを落とす要因になります。KOYA と ZAO は、まさにこのギャップを埋めるために設計されています。

KOYA:ターゲット構造に基づく設計

KOYA は SG の設計ツールです。ターゲットの立体構造情報を直接の入力として、候補分子の提案と最適化を行います。各設計判断を結合部位のジオメトリに紐づけたまま進められる点が特徴で、構造情報を「後から確認する参照」として扱うのではなく、設計プロセスの中心に据えています。

ZAO:次段階に進める前の候補分子プロファイリング

ZAO は SG のプロファイリングツールです。設計された候補分子をターゲット構造に対して計算的に評価し、パイプラインの次段階に進める前に、構造的な観点からの評価軸をチームに提供します。

この組み合わせが意味すること

KOYA と ZAO を組み合わせることで、プログラムの各段階において設計と評価を同じ構造的な文脈の中に保つことができます。「分子を作ること」と「分子を評価すること」を、レビュー会議で初めて突き合わせる分断された工程として扱うのではありません。両ツールとも現在 GA(一般提供)段階です。

SG では優先順位付けのための機能 HAKUBA についても検討を進めていますが、これは早期関心の段階にあり、商用提供前です。想定される提供時期は2027年第4四半期頃で、現時点で完成した機能として言及できるものではありません。進展があれば改めてお伝えします。

研究チームにとっての位置づけ

構造ベース設計向けの AI 支援ツールを検討中で、KOYA と ZAO が既存のパイプラインにどのように組み込めるか技術的に話を聞きたいという場合は、[SGへお問い合わせください] — 詳細についてご説明します。